More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1286 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  68.1 
 
 		 474 aa  673    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  100 
 
 		 461 aa  973    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  64.36 
 
 		 482 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  66.67 
 
 		 467 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  51.2 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.96 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  46.51 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.85 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  46.05 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  45.49 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  45.83 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  45.4 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  45.59 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  44.21 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  45.28 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  45.18 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  46.28 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.07 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  46.28 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  46.28 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  42.41 
 
 		 473 aa  329  6e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  36.42 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  41.33 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  38.11 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  24.87 
 
 		 397 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  22.52 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  26.37 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 381 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 377 aa  67  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.7 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  22.73 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  26.09 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.34 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  26.38 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  22.89 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  26.09 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>