More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4517 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
452 aa  945    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
462 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
478 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  29.56 
 
 
450 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
448 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
451 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
452 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
403 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
434 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
481 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
448 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
476 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
458 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
484 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
435 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
462 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
483 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  21.9 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  22.81 
 
 
440 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  23.54 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 
428 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
427 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
445 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
423 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
457 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  25.05 
 
 
449 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 
439 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
490 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
435 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.3 
 
 
437 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
468 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
451 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 
447 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  22.17 
 
 
436 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
463 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
444 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
480 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 
477 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 
451 aa  96.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 
471 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
444 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 
518 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
464 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  21.89 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
353 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  33.52 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  33.81 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  27.92 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  39.58 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  26.43 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  34 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.21 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.67 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  24.74 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.72 
 
 
313 aa  67  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>