More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1399 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  67.23 
 
 		 484 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  70.49 
 
 		 473 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 487 aa  1013    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  62.73 
 
 		 481 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  52.86 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  51.78 
 
 		 483 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  51.14 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  50.93 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  43.64 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  39.29 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  41.06 
 
 		 444 aa  296  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 		 435 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  34.24 
 
 		 468 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 435 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  36.74 
 
 		 427 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  29.52 
 
 		 437 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 428 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 436 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.37 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 501 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  36.54 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.19 
 
 		 335 aa  67  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 345 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 378 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  21.81 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  36.45 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.85 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  24.26 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>