More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3204 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 478 aa  997    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  50.85 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  48.92 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  45.2 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  47.3 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  45.81 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  37.11 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 435 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 		 449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 484 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 499 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 435 aa  120  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.39 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34.15 
 
 		 362 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 487 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 501 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.96 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.71 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.84 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.93 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  29.81 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  29.81 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>