More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3260 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 449 aa  941    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  52.55 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  54.32 
 
 		 451 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  52.74 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  51.74 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  39.09 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.85 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  38.49 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  38.49 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  38.28 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  38.28 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  37.83 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  37.61 
 
 		 459 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  37.61 
 
 		 459 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  37.63 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.19 
 
 		 455 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  38.72 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  38.72 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  38.72 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  36.98 
 
 		 471 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.72 
 
 		 495 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.53 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  35 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.47 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  30.09 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 		 359 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  23.02 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  25.81 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>