More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2602 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  70.96 
 
 		 459 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  68.88 
 
 		 467 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  73.14 
 
 		 459 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  71.18 
 
 		 459 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  99.56 
 
 		 456 aa  951    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  71.4 
 
 		 459 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 456 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  71.4 
 
 		 459 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  99.78 
 
 		 456 aa  952    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  84.18 
 
 		 455 aa  800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  73.36 
 
 		 459 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  73.58 
 
 		 459 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  71.18 
 
 		 459 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  73.36 
 
 		 459 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  71.3 
 
 		 456 aa  690    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  51.27 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  51.74 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  44.44 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  44.71 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  42.22 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  46.32 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  41.34 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  41.93 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  39.57 
 
 		 474 aa  332  8e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  41.19 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.91 
 
 		 495 aa  316  4e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  37.45 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  35.08 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  26.74 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  34.68 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  29.22 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  28.36 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  33.33 
 
 		 336 aa  67  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  36.61 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.95 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  35.96 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  36.96 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>