More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6637 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  80.88 
 
 
458 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  100 
 
 
435 aa  913    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  59.48 
 
 
464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  55.08 
 
 
451 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  51.74 
 
 
449 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  41.11 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  40.24 
 
 
456 aa  338  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  40.87 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  41.93 
 
 
456 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  41.93 
 
 
456 aa  336  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  40.62 
 
 
459 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  41.93 
 
 
456 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.9 
 
 
459 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  40.38 
 
 
459 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 
459 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  40.38 
 
 
459 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  40.19 
 
 
467 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  40.38 
 
 
459 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  40.14 
 
 
459 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.48 
 
 
455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  38.5 
 
 
481 aa  298  9e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  37.07 
 
 
471 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  38.37 
 
 
473 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  38.11 
 
 
461 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  37.32 
 
 
467 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 
474 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.49 
 
 
482 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 
474 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.02 
 
 
495 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.38 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.49 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  23 
 
 
480 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
434 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.62 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
455 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
326 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
462 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
435 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
449 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
390 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  24.83 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
501 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  30.34 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  25.16 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
315 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
459 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  24.31 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
333 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  22.41 
 
 
348 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
338 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
358 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
362 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
344 aa  56.6  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
349 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  20.19 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
341 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>