More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1194 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  68.27 
 
 		 459 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  69.8 
 
 		 459 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  68.93 
 
 		 459 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  84.18 
 
 		 456 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  69.15 
 
 		 459 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  84.4 
 
 		 456 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  69.58 
 
 		 459 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  68.17 
 
 		 467 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  69.15 
 
 		 459 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  84.4 
 
 		 456 aa  807    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 455 aa  954    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  70.02 
 
 		 459 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  68.93 
 
 		 459 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  70.02 
 
 		 459 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  69.76 
 
 		 456 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  53.95 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  52.19 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  45.09 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  45.3 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  43.48 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  41.69 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  45.17 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  40.35 
 
 		 458 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  40.23 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  40.48 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.04 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.11 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  33.76 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  26.62 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.44 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  30.67 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  26.02 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 333 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30.26 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.76 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  30 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  22.91 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  27.32 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 349 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.21 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.05 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>