More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4289 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 374 aa  782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  84.55 
 
 		 371 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  64.32 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  60.76 
 
 		 367 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  47.06 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  46.67 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 431 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  29.63 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 458 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.48 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  31.76 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 464 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.48 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.56 
 
 		 459 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  22.98 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  22.98 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  22.98 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.07 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  22.98 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  23.26 
 
 		 459 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 		 456 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 		 459 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  22.96 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  36.29 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.6 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.12 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 481 aa  82.8  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  33.1 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  34.23 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.48 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  32.43 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  32.67 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  27.35 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  22.84 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  29.35 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>