More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4171 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 396 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  70.28 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  68.34 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  67 
 
 		 400 aa  554  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  65.15 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  62 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  61.15 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  62.94 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  46 
 
 		 431 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 367 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.59 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.22 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  34.25 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.38 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  28.38 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  28.38 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.3 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.13 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.88 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  24.03 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.9 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.88 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.68 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.27 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  23.02 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.01 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.47 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.13 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  36.63 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.47 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  25.97 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  28.35 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  26.62 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  19.81 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  29.38 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>