More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1003 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 458 aa  954    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  80.88 
 
 		 435 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  57.94 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  56.5 
 
 		 451 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  52.55 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  40.69 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  40.17 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  40.17 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.32 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  39.53 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  39.74 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  39.53 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  39.32 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  38.28 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  42.27 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  42.05 
 
 		 456 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  42.05 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.73 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  35.91 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  38.39 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  36.27 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.02 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  35.76 
 
 		 474 aa  257  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.32 
 
 		 495 aa  253  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.19 
 
 		 397 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  33 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  26.96 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  30.87 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  26.29 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  25.39 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  25.47 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>