More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0017 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 481 aa  1005    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  69.25 
 
 		 473 aa  633  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  53.05 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  53.26 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  53.05 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  53.05 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  52.42 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  52.42 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 459 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  52.21 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  50.84 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  55.06 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  55.29 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  55.29 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  50.31 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.95 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  39.38 
 
 		 482 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  37.18 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  42.52 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  41.33 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  35.5 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  38.5 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  34.49 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.32 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  37.21 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  24.03 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  20.78 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.85 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  23.5 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.32 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  25.84 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  29.37 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  31.97 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 364 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  23.11 
 
 		 429 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 459 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.93 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 		 485 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.01 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  22.44 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  23.53 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 337 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 312 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  25.81 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.93 
 
 		 337 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>