More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2670 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
360 aa  752    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  76.39 
 
 
360 aa  594  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  77.22 
 
 
363 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  64.31 
 
 
359 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  57.79 
 
 
356 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.51 
 
 
356 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.23 
 
 
356 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  54.75 
 
 
352 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  55.56 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  54.08 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  53.63 
 
 
352 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  56.25 
 
 
344 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  50.42 
 
 
341 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  51.83 
 
 
337 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
337 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.08 
 
 
337 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.29 
 
 
337 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
715 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.77 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.45 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  28.57 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  26.75 
 
 
335 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  28.14 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.54 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
325 aa  86.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.73 
 
 
330 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.7 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.72 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  27.76 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  27.19 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  28.16 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  27.19 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  26.75 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  25.3 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  28.93 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  27.18 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  28.39 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  27.18 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  23.9 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.2 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  27.18 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.88 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.98 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  21.75 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  21.75 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  23.05 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.21 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  21.91 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  25 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  23.08 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  31.41 
 
 
421 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.97 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  23.02 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  34.11 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  29.82 
 
 
314 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  24.33 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  23.78 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.19 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.83 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>