More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2903 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 352 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  95.14 
 
 		 353 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  79.49 
 
 		 354 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  76.14 
 
 		 352 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  75.5 
 
 		 356 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  75.85 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  75.85 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  71.18 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  68.21 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  68.48 
 
 		 337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  56.74 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  56.02 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  53.63 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  56.98 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  41.3 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  40.58 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  40.58 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  32.23 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.69 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.27 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.31 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.95 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.12 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  29.89 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.1 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.1 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.64 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  34.07 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  25.08 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.88 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.57 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.69 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.94 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.86 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  27.81 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.82 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  25.44 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  26.18 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  27.65 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  32.37 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 699 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.63 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  26.98 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.13 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  33.79 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 699 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.47 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.49 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  28.49 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  24.78 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 667 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>