More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1960 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  99.15 
 
 		 351 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  100 
 
 		 351 aa  739    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  98.86 
 
 		 351 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  99.15 
 
 		 351 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  99.14 
 
 		 347 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  99.15 
 
 		 351 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  99.15 
 
 		 351 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  98.29 
 
 		 351 aa  727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  75.64 
 
 		 351 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  48.13 
 
 		 348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  44.09 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  41.25 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  37.15 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  36.34 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.28 
 
 		 369 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 349 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30.7 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 358 aa  142  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.2 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.92 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  31.16 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.69 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  30.71 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30.36 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  37.42 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.86 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.76 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  28.73 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 392 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 366 aa  95.9  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  26.33 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  34.54 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>