More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5577 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
342 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  63.61 
 
 
348 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  65.53 
 
 
341 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  58.2 
 
 
333 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  57.59 
 
 
333 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  59.45 
 
 
341 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0522  putative oxidoreductase  60.12 
 
 
341 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  60.06 
 
 
341 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  59.75 
 
 
337 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  57.89 
 
 
338 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  59.44 
 
 
337 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  59.44 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
359 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 
355 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
367 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.79 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  27.34 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 
358 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
347 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 
378 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
351 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
349 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
366 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 
354 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
348 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
362 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
377 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.86 
 
 
347 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  29.86 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.38 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.38 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.38 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.91 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  30.69 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  34.94 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 
342 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  27.52 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.65 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
667 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
378 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
397 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.48 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
667 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  29.64 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  30.4 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  31.97 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.5 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.18 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.09 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>