More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5260 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
371 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  55.93 
 
 
361 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  53.7 
 
 
400 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  51.78 
 
 
385 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  47.95 
 
 
404 aa  302  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  46.88 
 
 
355 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  48.72 
 
 
373 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  44.19 
 
 
366 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
365 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
357 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 
357 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.04 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 
361 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
391 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
412 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
364 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 
387 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
365 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
335 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
358 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.89 
 
 
375 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.15 
 
 
331 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
350 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
350 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
387 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.59 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 
337 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
345 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
349 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
356 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
377 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
347 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 
368 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.86 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.01 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.97 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 
360 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 
360 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.81 
 
 
339 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.53 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.37 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
357 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
333 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
369 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
364 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
356 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 
337 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 
353 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
347 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
353 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
333 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
351 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
345 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
367 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.36 
 
 
347 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.43 
 
 
335 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
338 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.28 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.28 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.28 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.28 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.28 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.28 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  29.91 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
355 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
330 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.42 
 
 
343 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.13 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>