More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4818 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 361 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  60.05 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  55.93 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  54.32 
 
 		 385 aa  338  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  48.31 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  45.61 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  49.57 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  46.95 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  36.92 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.73 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 387 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  37.92 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.38 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.2 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.53 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.13 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.86 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.67 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.74 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 350 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.32 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.32 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.13 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.32 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.32 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.32 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.32 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.7 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.48 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  33.73 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>