More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1658 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  750    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  59.08 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  52.74 
 
 		 354 aa  358  9e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  50.45 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  49.43 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  50.14 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  50.15 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  47.28 
 
 		 353 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  45.09 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  47.41 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  44.8 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  44.51 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  44.22 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  45.95 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  43.84 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  42.17 
 
 		 357 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  45.38 
 
 		 345 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  45.51 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  43.3 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  33.42 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  34.46 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  34.37 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.4 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.31 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.8 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 339 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.15 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 334 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.87 
 
 		 331 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  21.69 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.36 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  29.56 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  27.42 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.63 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.76 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 356 aa  85.9  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  25.77 
 
 		 340 aa  86.3  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.29 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.81 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  25.18 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  25.18 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.13 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  24.47 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  24.47 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  22.97 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  24.8 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  26.63 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  24.79 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  24.8 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>