More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0533 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
337 aa  693    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  31.29 
 
 
345 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 
326 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  36.29 
 
 
326 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
316 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  28.82 
 
 
328 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  31.86 
 
 
333 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 
348 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  33.21 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
367 aa  99.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  22.97 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
345 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  28.94 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  27.5 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.11 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  26.62 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.74 
 
 
347 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
347 aa  89.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  26.65 
 
 
301 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
353 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.51 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
387 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.1 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  26.49 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  27.86 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  24.73 
 
 
390 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  24.2 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  25.69 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.25 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.67 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  22.22 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.09 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
468 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  21.87 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  22.47 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  23.19 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  26.28 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.28 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  27.42 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  22.56 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.83 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.18 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  24.36 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  21.62 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  21.65 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.14 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  23.8 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  24.32 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>