More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4498 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  100 
 
 		 372 aa  769    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  75.07 
 
 		 355 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  66.57 
 
 		 352 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  63.19 
 
 		 353 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  57.39 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  49.43 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  44.35 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  46.7 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  44.7 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  44.8 
 
 		 350 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  41.57 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  42.18 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  43.52 
 
 		 345 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  40.71 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  40.71 
 
 		 350 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  41.95 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  41.3 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  41.59 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  40.41 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  40.97 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  31.39 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  31.65 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  31.94 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.3 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.73 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.9 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.29 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.95 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  29.8 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.35 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.54 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.83 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.69 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.61 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.61 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 329 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.97 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.7 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.18 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.86 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  32.75 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.11 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.34 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  29.13 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.96 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.34 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>