More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2218 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  100 
 
 
330 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.77 
 
 
318 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.46 
 
 
332 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  65.72 
 
 
318 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  63.26 
 
 
317 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  41.99 
 
 
517 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  41.35 
 
 
517 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  38.06 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  39.62 
 
 
344 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  38.78 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  37.86 
 
 
345 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  39.06 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  35.33 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 
328 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 
345 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
317 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 
311 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
326 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.72 
 
 
350 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
347 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
371 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  34.15 
 
 
370 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
341 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.26 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
352 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.17 
 
 
312 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
358 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
337 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
364 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  31.37 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.01 
 
 
344 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  34.62 
 
 
346 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.56 
 
 
313 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
353 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  30.09 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  30.15 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  27.69 
 
 
344 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  31.41 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.5 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.44 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
340 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.33 
 
 
345 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
329 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
355 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
356 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
356 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  27.07 
 
 
375 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.69 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.43 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
318 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
319 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  29.9 
 
 
320 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.73 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  32.9 
 
 
316 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.92 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  29.5 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  30.19 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.97 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
335 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.29 
 
 
310 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.84 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  29.64 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 
341 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
322 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  33.12 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  28.97 
 
 
335 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  28.12 
 
 
340 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.09 
 
 
329 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.09 
 
 
428 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
327 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
356 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  30.84 
 
 
649 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  27.81 
 
 
340 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  26.1 
 
 
334 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  28.04 
 
 
335 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
365 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 
358 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
337 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 
311 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>