More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4185 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
377 aa  758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 
387 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
358 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
366 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  34.6 
 
 
347 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
350 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  36.77 
 
 
412 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 
357 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  32.98 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 
360 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 
360 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
357 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
388 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 
349 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.31 
 
 
331 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.58 
 
 
353 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  36.71 
 
 
339 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 
387 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
356 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
326 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
353 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
374 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
347 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
339 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
361 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.32 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.95 
 
 
343 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
344 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
383 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
391 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.89 
 
 
404 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
358 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  33.2 
 
 
341 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.86 
 
 
363 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
345 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  36.57 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 
371 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
333 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.02 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.91 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.6 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  31.5 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
334 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.37 
 
 
357 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
357 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
345 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.89 
 
 
390 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 
352 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
359 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
321 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.46 
 
 
368 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
333 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
350 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
358 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
355 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
353 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
356 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
347 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
369 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
362 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
373 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
370 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
344 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 
385 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
341 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
381 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
353 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  31.58 
 
 
347 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
368 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
350 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
333 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.17 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
368 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
354 aa  99.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
350 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>