More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3904 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  98.77 
 
 
324 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  51.13 
 
 
323 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 
1080 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  40.06 
 
 
1079 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  41.5 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  42.9 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
354 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
358 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
350 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 
350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 
350 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.48 
 
 
352 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
344 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.2 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
345 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.8 
 
 
372 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02580  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
456 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346207  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.63 
 
 
390 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
355 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30.84 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  27.35 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.37 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  27.75 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  30.37 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  30.37 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  30.37 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  35.5 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  27.13 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  26.61 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
379 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.91 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  28.32 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.84 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.48 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.36 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  28.4 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.51 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.72 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  23.79 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  19.78 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.4 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  29.12 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  25 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  25.58 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.48 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03460  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  25 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.54 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.44 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  28.62 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  25.9 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>