More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0349 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 350 aa  726    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  47.55 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  45.35 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  41.45 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  39.77 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  37.54 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  37.71 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  37.71 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  33.72 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  36.8 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 387 aa  208  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  34.56 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 357 aa  205  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  35.18 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  32.68 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  32 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  31.44 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  29.31 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  30.22 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  30.7 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  29.77 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.72 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.4 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  28.49 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.3 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  22.25 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.8 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  25.21 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  24.93 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.83 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.75 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.73 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.86 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 458 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.27 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>