More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64256 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  100 
 
 
374 aa  777    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  53.99 
 
 
390 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  39.59 
 
 
398 aa  256  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 
345 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
350 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
350 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 
350 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 
353 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  34.28 
 
 
350 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  32.14 
 
 
357 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  34.28 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.33 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.43 
 
 
347 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  34.37 
 
 
367 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
353 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  33.89 
 
 
354 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 
358 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  31.65 
 
 
372 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 
355 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
352 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
350 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.23 
 
 
363 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
338 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
356 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  23.59 
 
 
352 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  22.97 
 
 
353 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.89 
 
 
331 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  24.72 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  22.73 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
328 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
328 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
344 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  25 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  24.65 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  27.35 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.42 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  26.35 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.72 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.72 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  30.77 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.14 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.89 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.36 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.13 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  23.97 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.18 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
310 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  24.65 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.13 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.27 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  31.11 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.63 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>