More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 344 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  53.71 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  52.92 
 
 		 346 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  43.98 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  38.21 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1243  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  32.12 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.7 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  39.83 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  31.32 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 377 aa  92.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 468 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.94 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.47 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1882  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000416428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0518  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 435 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  29.17 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 372 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.11 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 435 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  31.05 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 312 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1364  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.96 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.45 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.67 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.03 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.35 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.84 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  35.03 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.05 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.05 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.71 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  30 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>