More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2956 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  100 
 
 
303 aa  616  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
353 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 
435 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
435 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 
435 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
369 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 
356 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
331 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
372 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.32 
 
 
438 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
335 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  33.67 
 
 
367 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  26.51 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  33.67 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  33.67 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
458 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
386 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  33.67 
 
 
367 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
336 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  32.2 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 
337 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 
382 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  36.48 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 
387 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
405 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
331 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  27.4 
 
 
346 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 
366 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  36.42 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
405 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
385 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  29.71 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 
432 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
667 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
338 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  27.33 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
385 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 
355 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  27.55 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.07 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  26.51 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.03 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  31.43 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  27.87 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  28.23 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  29.07 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.93 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.88 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>