More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3785 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  52.51 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  46.92 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  46.59 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  46.59 
 
 		 435 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  44.15 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  46.83 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  46.83 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  43.79 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  43.24 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  43.99 
 
 		 432 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  43.7 
 
 		 349 aa  292  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  42.27 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  46.04 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  44.57 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  42.98 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  40.8 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  41.44 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  41.49 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  41.9 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  42.37 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  40.33 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  42.14 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  41.84 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  33.61 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  36.04 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.48 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.31 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.13 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.58 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.27 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  26.63 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.35 
 
 		 334 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.9 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.09 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.73 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.73 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 667 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  29.23 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  32.82 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.81 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  32.82 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.87 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  32.82 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  32.82 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 667 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>