More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2125 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
347 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  55.79 
 
 
346 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  53.71 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  39.7 
 
 
330 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  43.15 
 
 
334 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
334 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1243  oxidoreductase domain-containing protein  36.61 
 
 
318 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
347 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 
356 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.27 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
342 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.87 
 
 
326 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
363 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
334 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  37.21 
 
 
435 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
332 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
468 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.36 
 
 
433 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.27 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  37.58 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.76 
 
 
438 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
364 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  31.14 
 
 
319 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  36.32 
 
 
358 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  27.49 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.14 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.8 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  30.77 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.36 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 
366 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  35.02 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  29.95 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  37.38 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.83 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  37.66 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.06 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.75 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  37.66 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  37.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  37.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  37.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  37.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  37.66 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.9 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.41 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  37.01 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  29.95 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  29.95 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  29.95 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  29.95 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  27.24 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  37.21 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>