More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2682 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  97.95 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  92.4 
 
 		 342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  78.59 
 
 		 331 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  76.23 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  57.4 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  51.79 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.36 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.36 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  34.44 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  34.94 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.2 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.57 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.95 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  32.17 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.73 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  31.67 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.47 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  34.18 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  37.45 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.48 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.2 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.13 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  30.84 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  28.48 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  33.82 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  33.5 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  42.07 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  39.05 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  38.29 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 381 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.82 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.23 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.31 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.48 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.97 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 393 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>