More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3430 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 353 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  51.07 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  55.45 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  48.32 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  50.15 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  50.61 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 433 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  31.95 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.23 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 396 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.03 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  29.62 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.75 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.39 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.29 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 458 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 		 468 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  34.1 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  29.06 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.44 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  33.87 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 667 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 399 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.07 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.89 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 667 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  37.74 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  32.96 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.68 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  33.33 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  32.84 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  26.85 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  38.26 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  33.67 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  33.67 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  33.67 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>