More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3569 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  64.13 
 
 
333 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  66.26 
 
 
336 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  62.08 
 
 
333 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.77 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  60.86 
 
 
333 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  58.64 
 
 
334 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  53.66 
 
 
334 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  54.82 
 
 
331 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  53.82 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.29 
 
 
336 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  42.43 
 
 
340 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
343 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
342 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 
433 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
435 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 
435 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
435 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
331 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
432 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
342 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
321 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.76 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  32.09 
 
 
322 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  32.14 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
327 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 
387 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.27 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.72 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
331 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
468 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
345 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  33.67 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
359 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
338 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.33 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.36 
 
 
438 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
374 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.79 
 
 
337 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
358 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
328 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  34.1 
 
 
376 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  29.65 
 
 
345 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
333 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.51 
 
 
335 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
325 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  35.29 
 
 
404 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
667 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  29.65 
 
 
345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.65 
 
 
345 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
356 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  29.94 
 
 
345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  29.94 
 
 
345 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.65 
 
 
345 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
338 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
337 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
396 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 
337 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 
382 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  32 
 
 
352 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
327 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.64 
 
 
338 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
349 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  35.38 
 
 
329 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 
372 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
356 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
358 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
325 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
328 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  26.98 
 
 
368 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.23 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 
330 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.49 
 
 
335 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
357 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.3 
 
 
369 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
328 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 
332 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.77 
 
 
388 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>