More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0530 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 368 aa  750    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  54.47 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  52.57 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  48.07 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  48.07 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  33.83 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.05 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  28.21 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  32.83 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  32.36 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.09 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.69 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.69 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.69 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.81 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.43 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.12 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.17 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.21 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  25.28 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 		 329 aa  89.7  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.29 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  27.18 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.68 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  24.55 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  24.91 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.63 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.21 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.82 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.52 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.54 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  23.88 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>