More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2038 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  56.32 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  25.9 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  25.07 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 353 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.71 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.01 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.52 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  24.9 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  22.1 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.14 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.14 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.1 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  24.36 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.14 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.45 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  27.87 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.87 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  23.94 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  23.42 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  25.83 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  26.26 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  23.38 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  33.06 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  33.05 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  25.08 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.08 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  29.19 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.32 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.35 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>