More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0573 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  88.92 
 
 
373 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  55.65 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  58.36 
 
 
373 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  57.49 
 
 
366 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  56.04 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  54.42 
 
 
379 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  59.23 
 
 
375 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  54.42 
 
 
366 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  53.95 
 
 
380 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  53.95 
 
 
368 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 
369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  44.41 
 
 
368 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  44.79 
 
 
368 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  46.75 
 
 
378 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  45.38 
 
 
374 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  43.77 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  42.58 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  43.65 
 
 
379 aa  279  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  43.9 
 
 
366 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  43.64 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  40.87 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  43.44 
 
 
366 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  44.19 
 
 
357 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  42.15 
 
 
380 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  41.08 
 
 
368 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  41.11 
 
 
365 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  42.11 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  38.74 
 
 
388 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  39.07 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  37.64 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  38.8 
 
 
382 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 
377 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  36.89 
 
 
377 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  38.46 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  37.64 
 
 
377 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  37.13 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  39.88 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 
357 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  38.78 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  33.6 
 
 
391 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 
644 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
358 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
364 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
352 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
369 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
372 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
657 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.34 
 
 
378 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.34 
 
 
378 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 
378 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
665 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.72 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.5 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.22 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  29.52 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  21.17 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.92 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.37 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  26.61 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  29.63 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>