More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4490 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  100 
 
 
345 aa  690    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  46.08 
 
 
339 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
359 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
350 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
344 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 
353 aa  155  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
383 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.65 
 
 
349 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  31.59 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  31.59 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
355 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 
337 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
356 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
345 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
388 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  34.02 
 
 
356 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  36.48 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
412 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  36.96 
 
 
356 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.53 
 
 
363 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 
383 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
341 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
371 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  28.5 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.88 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 
387 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.83 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.5 
 
 
404 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
326 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.61 
 
 
353 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
375 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
335 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 
365 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
374 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
400 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
361 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 
364 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
349 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
357 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
367 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
352 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  30.08 
 
 
356 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
359 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  32.42 
 
 
337 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
365 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
385 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
390 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.41 
 
 
366 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.88 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  28.16 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
369 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
359 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
359 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.81 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  22.87 
 
 
376 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 
378 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
356 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.43 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  25.61 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
359 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
349 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
393 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  35.39 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
359 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
326 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
355 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>