More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2547 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  38.55 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  38.21 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.84 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  33.24 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  32.41 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  30.21 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  29.21 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30.11 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 325 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 363 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  28.12 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.12 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  21.36 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.44 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.8 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.18 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  20.63 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.55 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  31.21 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  22.6 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  22.03 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  29.43 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.02 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.31 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  25 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.31 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  22.03 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>