296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2277 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
353 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  51.14 
 
 
359 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.85 
 
 
359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  51.29 
 
 
360 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  47.09 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  45.98 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  45.74 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  41.89 
 
 
358 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  38.21 
 
 
360 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  33.83 
 
 
368 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  28.91 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
363 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
356 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.8 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  22.73 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.78 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  25 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  23.88 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
680 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
391 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  24.42 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.12 
 
 
312 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3733  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
358 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  25.1 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.19 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.29 
 
 
438 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2313  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
616 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  29.2 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  29.2 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.57 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.08 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  29.2 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  29.2 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  24.35 
 
 
352 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
377 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.1 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  32.08 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
320 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  29.2 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 
360 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 
360 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
385 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
414 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.07 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>