More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2273 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  69.71 
 
 
305 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  62.91 
 
 
321 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  63.33 
 
 
321 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  60.46 
 
 
309 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  58.5 
 
 
306 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  57.84 
 
 
307 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  59.15 
 
 
307 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  59.15 
 
 
307 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  59.15 
 
 
307 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  59.15 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  58.82 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  56.86 
 
 
307 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  56.86 
 
 
307 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  56.86 
 
 
307 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  56.86 
 
 
307 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  56.54 
 
 
307 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  56.86 
 
 
307 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  56.54 
 
 
307 aa  347  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  56.54 
 
 
307 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.93 
 
 
308 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.93 
 
 
308 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.6 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.81 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  45.13 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.48 
 
 
308 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.16 
 
 
308 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.77 
 
 
308 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.3 
 
 
308 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.92 
 
 
308 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
305 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  34.87 
 
 
312 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  30.56 
 
 
310 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  36.52 
 
 
297 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.01 
 
 
311 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  32.25 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  31.38 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.52 
 
 
305 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
294 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
320 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
360 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
335 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.55 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.94 
 
 
354 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
359 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 
334 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
353 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
356 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  37.88 
 
 
337 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.7 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  24.53 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  22.98 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  22.29 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  22.98 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.55 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  26.47 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  22.47 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  28.08 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.55 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.55 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  23.78 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.75 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  28.43 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  27.09 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.62 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.62 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  21.7 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.13 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  23 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  23.34 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.12 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  28.72 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.67 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.13 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.53 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  38.17 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  32.94 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.77 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>