More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2013 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  34.98 
 
 
310 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  29.77 
 
 
307 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  30.15 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 
306 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  29.77 
 
 
307 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.77 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  29.77 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  29.39 
 
 
307 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  27.88 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
307 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  27.48 
 
 
307 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  25.77 
 
 
309 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  27.48 
 
 
307 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  27.1 
 
 
307 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.69 
 
 
308 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  27.1 
 
 
307 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.21 
 
 
308 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.49 
 
 
308 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  27.1 
 
 
307 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.25 
 
 
308 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 
297 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
308 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.92 
 
 
308 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.57 
 
 
308 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.57 
 
 
308 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.37 
 
 
308 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 
308 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 
309 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  27.74 
 
 
310 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.62 
 
 
311 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.5 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  30.56 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  32 
 
 
316 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  29.33 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.41 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  27.56 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  32.71 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  35.4 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  35.4 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  35.4 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
340 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  26.79 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.57 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
359 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 
712 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.57 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  34.51 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  34.51 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.81 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  26.82 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  42.31 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.37 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  25.74 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  28.66 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  31.86 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  26.37 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.81 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  33.04 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>