More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2793 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  68.21 
 
 
309 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  64.14 
 
 
307 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  63.49 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  63.49 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  67.11 
 
 
321 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  64.47 
 
 
307 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  64.47 
 
 
307 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  64.8 
 
 
307 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  63.49 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  63.16 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  63.16 
 
 
307 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  64.47 
 
 
307 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  64.47 
 
 
307 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  62.83 
 
 
307 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  66.11 
 
 
321 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  62.83 
 
 
307 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  63.16 
 
 
307 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  60.6 
 
 
305 aa  377  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  58.5 
 
 
307 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  46.38 
 
 
308 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.75 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.72 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.72 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.42 
 
 
308 aa  319  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.05 
 
 
308 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.42 
 
 
308 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.42 
 
 
308 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  45.57 
 
 
308 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.77 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
305 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  36.79 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  30.53 
 
 
310 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.83 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
297 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  28.48 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
294 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 
308 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.73 
 
 
305 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  27.27 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 
309 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
320 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.53 
 
 
352 aa  99  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.91 
 
 
312 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.42 
 
 
345 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
360 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.55 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.11 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.17 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  24.84 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.63 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  24.84 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.64 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  26.23 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.29 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  25.99 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  25.97 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.29 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.49 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  31.47 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  23.62 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.51 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.15 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  22.53 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.97 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  25.39 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>