More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2877 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  584  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  58.36 
 
 
309 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  49.83 
 
 
312 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  50.67 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  30.6 
 
 
310 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  32.79 
 
 
310 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
305 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
308 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.8 
 
 
311 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.61 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.41 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.29 
 
 
308 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.29 
 
 
308 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.29 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.61 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.41 
 
 
308 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 
307 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.29 
 
 
308 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.41 
 
 
308 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
308 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  33.88 
 
 
309 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  37.1 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  30.43 
 
 
310 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  37.72 
 
 
305 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  35.36 
 
 
307 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  35.11 
 
 
307 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  35 
 
 
307 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
307 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 
307 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  35 
 
 
307 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  34.29 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 
321 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 
321 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  33.33 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  33.33 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  34.64 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  33.33 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  33.33 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  36.64 
 
 
334 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.25 
 
 
305 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
335 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  38.3 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  37.69 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
360 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  41.03 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0190  oxidoreductase domain-containing protein  25.25 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  34.68 
 
 
388 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.87 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 
344 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  29.05 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  31.75 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
346 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  32.28 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  31.75 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  31.75 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  32.4 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  28.49 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0276  Inositol 2-dehydrogenase  32.52 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00976314  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  32.54 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  29.08 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
385 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  41.25 
 
 
393 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  43.48 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
330 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
331 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.22 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
334 aa  55.8  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  27.96 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
344 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>