More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2177 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
305 aa  627  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  69.71 
 
 
307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  62.33 
 
 
321 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  62.33 
 
 
321 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  60.6 
 
 
306 aa  377  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  58.94 
 
 
309 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  59.47 
 
 
307 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  60.47 
 
 
307 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  61.13 
 
 
307 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  60.47 
 
 
307 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  61.13 
 
 
307 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  60.8 
 
 
307 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  58.8 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  59.14 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  59.14 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  59.14 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  59.14 
 
 
307 aa  355  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  58.47 
 
 
307 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  58.8 
 
 
307 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  58.14 
 
 
307 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.05 
 
 
308 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.05 
 
 
308 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  46.05 
 
 
308 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.05 
 
 
308 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.72 
 
 
308 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  45.87 
 
 
308 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.1 
 
 
308 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.74 
 
 
308 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.88 
 
 
308 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.55 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  38.41 
 
 
312 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 
305 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  37.72 
 
 
297 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  30.61 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 
309 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  30.9 
 
 
310 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.72 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05288  oxidoreductase  29.76 
 
 
310 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.73 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 
360 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
335 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 
320 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  26.2 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  22.64 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
359 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.87 
 
 
345 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.15 
 
 
352 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
355 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  30.11 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  23.1 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  26.6 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 
347 aa  79  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.38 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  22.02 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  29.67 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.73 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  22.12 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  23.81 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  23.96 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  22.12 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  22.12 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  23.42 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  22.12 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  24.84 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  21.47 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  33.8 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.24 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  23.1 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.24 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.15 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  37.12 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  22.01 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>