More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0993 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 344 aa  704    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  79.07 
 
 		 344 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  74.93 
 
 		 345 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  75.87 
 
 		 353 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  75.23 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  41.37 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  41.02 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  38.44 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  40.52 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  38.69 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.82 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  37.89 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  37.43 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  36.98 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  36.58 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 355 aa  205  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  35.38 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.5 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  36.01 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.76 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  35.22 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  41 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  33.74 
 
 		 649 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  42.32 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.84 
 
 		 353 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  32.25 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  31.86 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  32.04 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  31.94 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  31.9 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  31.56 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.47 
 
 		 334 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.47 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  39.11 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  39.11 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.04 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  31.07 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  31.74 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  40.1 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.38 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.22 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.19 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  28.31 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.61 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  28.31 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.51 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.68 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  31.37 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.96 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  34.2 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 306 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.55 
 
 		 288 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 		 288 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 337 aa  96.3  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>