More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0824 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  55.96 
 
 		 307 aa  360  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  54.64 
 
 		 305 aa  346  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  59.79 
 
 		 295 aa  345  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  54.93 
 
 		 303 aa  331  8e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  37.06 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  37.06 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 327 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  37.5 
 
 		 353 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  37.38 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  36.1 
 
 		 360 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  36.66 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  35.16 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.56 
 
 		 340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.1 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  35.56 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.94 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  35.58 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.87 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  33.97 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  33.77 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 320 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.23 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  34.62 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  32.35 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  34.71 
 
 		 322 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  34.28 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  29.88 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.29 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.66 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.14 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  30.48 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  31.07 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  31.07 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.06 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.17 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.55 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.22 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  30.45 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.39 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.84 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  30.15 
 
 		 649 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  31.06 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 344 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.76 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  32.08 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  29.15 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  36.52 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 		 343 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  28 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.72 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>