More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2086 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  689    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 
314 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  42.63 
 
 
310 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  41.8 
 
 
322 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  40.12 
 
 
318 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.01 
 
 
310 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  41.82 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.07 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.57 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  39.08 
 
 
327 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  38.61 
 
 
320 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  38.61 
 
 
320 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 
326 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  38.58 
 
 
649 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
320 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  38.11 
 
 
319 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  38.23 
 
 
321 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 
355 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  37.34 
 
 
313 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  38.94 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.94 
 
 
345 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  44.49 
 
 
337 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 
344 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 
353 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 
319 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
359 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  37.77 
 
 
356 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  37.77 
 
 
356 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  38.34 
 
 
353 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  40.76 
 
 
347 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 
359 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  43.33 
 
 
326 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 
360 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.13 
 
 
352 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  36.56 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 
355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 
315 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  37.7 
 
 
356 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
334 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.47 
 
 
335 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
334 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  33.97 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.64 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 
344 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
327 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 
313 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  35.02 
 
 
313 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
331 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  31.03 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.08 
 
 
313 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 
303 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 
317 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  30.98 
 
 
332 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.35 
 
 
346 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.71 
 
 
345 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.13 
 
 
312 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
344 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  31.19 
 
 
340 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
335 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
340 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 
307 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
327 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  34.01 
 
 
305 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
311 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.83 
 
 
310 aa  142  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
361 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
334 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
318 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 
318 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  29.94 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  27.64 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.58 
 
 
330 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 
344 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
332 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
345 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
306 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  24.85 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.62 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.94 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.36 
 
 
288 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>