More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3133 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  47.54 
 
 
309 aa  236  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  33.55 
 
 
313 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.56 
 
 
316 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  34.65 
 
 
331 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  36.68 
 
 
335 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
312 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  35.39 
 
 
322 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.1 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.65 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  35.42 
 
 
335 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  32.29 
 
 
340 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
314 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
327 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  35.2 
 
 
327 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  31.35 
 
 
340 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.02 
 
 
353 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  33.23 
 
 
334 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  35.74 
 
 
340 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 
319 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  31.89 
 
 
334 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  40.59 
 
 
347 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 
318 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  34.6 
 
 
355 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  35.22 
 
 
354 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  31.83 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  34.59 
 
 
356 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  33.23 
 
 
346 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  31.27 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 
337 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  30.96 
 
 
334 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 
340 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  33.86 
 
 
356 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  33.86 
 
 
356 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  30.56 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.55 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  30.23 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  31.92 
 
 
649 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  38.37 
 
 
326 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  34.5 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.19 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.8 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.26 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.89 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.08 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.47 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
359 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.59 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
344 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  32.38 
 
 
332 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
341 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  34.29 
 
 
334 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
344 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.08 
 
 
310 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.73 
 
 
346 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
344 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
307 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
353 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
311 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
349 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  28.48 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  38.04 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
361 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.91 
 
 
338 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
361 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
303 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.48 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  37.04 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
337 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.1 
 
 
337 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  27.79 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.62 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  42.02 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  28.35 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.46 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  36.76 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>