More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09533 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  100 
 
 		 319 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  76.49 
 
 		 321 aa  514  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  74.68 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  55.06 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  46.3 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  44.73 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  43.11 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.06 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  41.37 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.19 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  44.16 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  42.04 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  42.04 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  43.59 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  42.12 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.82 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.09 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  39.76 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  41.39 
 
 		 649 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  40.19 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  38.11 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  41.4 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  40.19 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 327 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.82 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  40.84 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  41.83 
 
 		 347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  37.22 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 360 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  33.44 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  34.38 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.22 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 355 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.33 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  34.7 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.23 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  33.54 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  33.44 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.59 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  32.59 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  32.59 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  34.93 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  36.89 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.06 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.75 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.23 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.6 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.92 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.15 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  30.46 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.08 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  29.21 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.48 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.55 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.26 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  27.54 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.26 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.7 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.27 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.71 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  25.77 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  26.41 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>