More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1174 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
317 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.34 
 
 
319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  66.03 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  62.58 
 
 
310 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  60.06 
 
 
313 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  62.25 
 
 
312 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  58.52 
 
 
314 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  57.37 
 
 
320 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  57.37 
 
 
320 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  61.56 
 
 
316 aa  364  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  60.26 
 
 
310 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  56.68 
 
 
322 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  55.63 
 
 
327 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  55.63 
 
 
327 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  50.32 
 
 
318 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  52.54 
 
 
649 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  45.57 
 
 
331 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  51.47 
 
 
326 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.19 
 
 
319 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  42.9 
 
 
346 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  40.51 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  43.77 
 
 
319 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  41.07 
 
 
341 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  40.32 
 
 
321 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  39.45 
 
 
320 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  45.14 
 
 
347 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  38.83 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.1 
 
 
345 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  38.65 
 
 
359 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  42.16 
 
 
313 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  42.16 
 
 
313 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  41.22 
 
 
320 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 
344 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  37.22 
 
 
334 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.02 
 
 
352 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  37.91 
 
 
335 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  37.22 
 
 
334 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 
315 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  35.87 
 
 
353 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  37.54 
 
 
340 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  37.22 
 
 
334 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  36.25 
 
 
334 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.87 
 
 
359 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  36.45 
 
 
335 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  36.19 
 
 
354 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
355 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.02 
 
 
360 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
356 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
356 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  35.83 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  35.95 
 
 
340 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.95 
 
 
340 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 
323 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 
340 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
344 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  36.1 
 
 
327 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.86 
 
 
356 aa  175  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  38.75 
 
 
320 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  36.46 
 
 
309 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 
318 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  34.54 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
331 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  34.1 
 
 
345 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 
317 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 
361 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  33.99 
 
 
332 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
327 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 
311 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  32.41 
 
 
332 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.13 
 
 
312 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.94 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
306 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  31.8 
 
 
310 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
335 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
303 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  32.53 
 
 
334 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 
361 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.88 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  32.37 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 
318 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
303 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  30.97 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.92 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
295 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  32.79 
 
 
328 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
334 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 
345 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  29.18 
 
 
332 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
345 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
343 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
345 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
345 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 
338 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 
310 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.83 
 
 
332 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>